HMGセミナー 第10章: モデル生物、比較ゲノム学、進化 (1)

担当：寺嶋
参加者：14名
教科書：ヒトの分子遺伝学

節の概要：
＜10.1節＞単細胞生物からヒトまでの様々なモデル生物について
＜10.2節＞コード配列の純化選択による保存や正の選択による進化と、比較ゲノム解析の仕組みやブラウザ、利用方法

議論点：
「非コードRNA(ncRNA)は生存するためにはどの程度必要なのか」


タンパク質の領域は少ない
　-ゲノムの殆どはガラクタ？
　　→ゲノムは広範囲に転写されており必要なncRNAもある
　　　-全部必要なものかもしれない？
　　　-無闇に転写される？
　　　　-何かあったときのため

ncRNAはどのように機能するか
　-調節が多い
　-転写は急速にできる

「生存できる」の定義
　-最低限必要なRNA
　-何らかの働きがあるRNAということではない
　-使用の有無を問わず、勝手に転写されるRNAは含まない

染色体の数%が無くても生存は可能
　-まだまだRNAの数は削る事が出来る？

恒温動物⇔変温動物
　-恒温動物の方がエネルギー消費は大きい

未知の環境に適応する事を考える
　-環境の厳しさをレベルで表す
　　-例：レベル２で必要なRNA△△

余計なコピーも害がなければ問題が無い
　-ゲノム的には無駄
　-飢餓状態なら影響があるかも？
　　→むしろ飢餓状態の対応を忘れた方が長生きできる
　　　-例：食料が豊富な実験室のマウス
　　　-環境に適応できない事は悪いことではない

短期と長期の適応
　-短期に対する過学習はよくない

その他の議論点：
＜人工合成学＞
・人工のモデル生物はどの程度実際のモデル生物に似ているのか
・人工生命体は作れるのか
・合成生物学の特徴とは何か

＜モデル生物としてのヒト＞
・ヒトをモデル生物とする研究は今後どのようになるのか
・2020年までに個人のゲノム配列決定は日常的になるのか

＜ヒト以外のモデル生物の解析＞
・酵母で人類が知るに値する事柄とは何か
・人以外のゲノムも簡単に読める時代が来るのか
・人間の脳に近い脳を持つマウスを作ることは可能だろうか

＜正の選択＞
・正の選択が起こる理由とは何か

＜比較ゲノム解析＞
・比較ゲノム学で現在残されている問題とは何か
・保存される非コード配列で偽陽性と判断されるものを減らす方法はあるのか

＜非コード配列の探索＞
・SNP頻度からヒトの遺伝子調節配列を見つけられないか？

まとめ：
今回はモデル生物とゲノムの進化と保存、比較ゲノム解析についての節で話題が多かったので、色々な内容の議論点が集まりました。議題となった生存に必要な非コードRNAについては、様々な条件を中心に環境への適応へと議論が発展していきました。